微信清空好友申请列表的方法如下：

1、在手机上登录微信，点击界面底下的通讯录，在界面上方点击新的朋友；

2、在新的朋友界面下，长按需要删除的好友申请消息，在此界面不能一次全部清空；

3、在弹出来的窗口上，点击删除的按钮即可。