第一，宝宝眼睛长眼屎可能是结膜炎症引起的，宝宝出生后，很多家长怕孩子着凉，所以家里室温往往较高，细菌也容易繁殖，加上新生儿会不自觉地用手揉眼睛，易出现眼睛分泌物增多、眼睑结膜充血等结膜炎症状。若是严重的细菌感染，或是感冒发热发生，则分泌物增多、泪水增多、眼球充血等症状会更明显，还可导致眼睑皮肤红肿。

第二，宝宝眼睛长眼屎可能是新生儿泪囊炎引起的，它是由于排泄泪液的泪道、鼻泪管堵塞引起，由于鼻泪管下端的胚胎性残膜没有退化，阻塞鼻泪管下端，泪液和细菌积聚在位于内眼角皮肤下的泪囊里，从而继发感染。约2%～4%的足月新生儿有这种残膜存在，大多数可在4～6周内自行萎缩。

第三，眼睛长眼屎可能是淋球菌性脓眼病为淋球菌感染所致，潜伏期为2～4天，常常由于母亲罹患淋病，新生儿在通过产道时被感染，双眼同时发病，表现为急性化脓性结膜炎症。通常患儿的眼皮会极度红肿，几乎睁不开，而且有大量的脓状眼屎源源不断地产生，若治疗不当，甚至会发生角膜溃疡，进而引起角膜穿孔，甚至有失明的危险。