野生鳝鱼是生活在淡水中的底栖鱼类，要求生活环境相对稳定，喜欢在光线较暗、水温差小、人为干扰少的地方栖息。喜欢栖息在松软且腐殖质多的浅水和静水淤泥中，离地面约30厘米营居生活。野生鳝鱼喜钻洞栖息，直接钻洞而不把土往外排，洞穴有二个甚至多个洞口，另有一个专供繁殖的叫繁殖洞，更宽大和隐蔽。野生鳝鱼的穴居性随温度、水位变化而变化，而且不同区域和不同规格的野生鳝鱼穴居性也不同。