1、贝加尔湖形成于约2500万年前印度板块和欧亚板块相互碰撞后的强烈地震，湖盆形成于2000~2500万年前。

2、前苏联科学家维列夏金根据古生物和地质方面的材料推测，中生代侏罗纪时的贝加尔湖以东地区，曾有过一个浩瀚的外贝加尔海。后来由于地壳变动，留下了内陆湖泊-贝加尔湖。随着雨水、河水的不断加入，咸水变淡。