在短时间保存的情况下，可以将金针菇洗净，放在水中浸泡，可以达到一定的保鲜作用，适用于保存一到两天的金针菇。需要较长时间保存的情况下，使用保鲜膜包裹金针菇，使其内部真空。放置在阴凉避光处，保持恒温，可以保存一个星期左右。不使用冰箱的情况下，金针菇根部稍微留些泥土，使金针菇根部保持活跃性，避免枯死变质。