自制菠萝酒的危害是导致有的人喝会因蛋白酶过敏而引起菠萝中毒，称为菠萝病。所以，对菠萝过敏者不可服用本酒。菠萝酒功效有清热解渴，消暑提神，化食止泻。适用于热病烦渴，伤暑，积食，泄泻等，亦可以提神，解除疲劳。