主要有胰蛋白酶和胶原蛋白酶。

胰蛋白酶是胰腺分泌的一种水解酶。能水解由肽链相连的氨基酸类化合物，具有酯酶活性。正常血清中含量甚微。测定血清胰蛋白酶对诊断急性胰腺炎有一定意义。

胶原蛋白酶广泛存在于动物内脏、植物茎叶、果实和微生物中。胶原蛋白酶，主要由霉菌、细菌，其次由酵母、放线菌生产。皮革工业的脱毛和软化已大量利用蛋白酶，既节省时间，又改善劳动卫生条件。蛋白酶还可用于蚕丝脱胶、肉类嫩化、酒类澄清。