认定条件不同：主要从事生产或提供应税劳务(特指加工、修理修配劳务)的：年销售额在100万元以上的，可以认定为一般纳税人，100万以下的为小规模;主要从事货物批发零售的：年销售额180万以上的可以认定为一般纳税人，180万以下为小规模。工业企业年销售额在100万以下的,商品流通企业年销售额在180万以下的,属于小规模纳税人;反之，为一般纳税人。

帐务处理上区别：在购买商品时，如果对方开具增值税发票，两者处理存在不同；在销售商品时，采用的税率不同。

税收管理规定的区别：一般纳税人：销售货物或提供应税劳务可以开具增值税专用发票;购进货物或应税劳务可以作为当期进项税抵扣;计算方法为销项减进项。小规模纳税人：只能使用普通发票;购进货物或应税劳务即使取得了增值税专用发票也不能抵扣;计算方法为销售额×征收率。

税率与征收率不同：一般纳税人：基本税率17%，税法还列举了5类适应13%低税率的货物，还有几项特殊业务按简易办法征收(参照小规模)。还有零税率应税劳务和货物。小规模纳税人：商业小规模按4%征收率;商业以为小规模按6%，(免税的除外)。