首先，阴道毛滴虫对甲硝唑很敏感，而且因为病症不仅仅局限于阴道，需要全身用药，最有效的就是甲硝唑口服。不过甲硝唑的副作用比较明显，像胃肠道症状如恶心、呕吐等，还有一些比较少见但较为严重，如白细胞减少、皮疹等，一旦出现应停止继续服药。

其次假如对口服甲硝唑的副作用无法耐受，可以考虑用局部治疗法，即使用内置药物，一般选用甲硝唑阴道泡腾片。不过注意放置药物时要做好个人卫生清洁。

最后，在进行治疗的过程当中，不能够同房，而且最好是可以男女双方共同进行治疗，如果只治疗女方，而忽视掉了男方，那么，在医院同房的时候，可能会再次造成感染的。