农村房屋办理房产证的流程为：

1、填写农村村民建房用地申请审批表，该表可在网上寻找；

2、提交申请人身份证明，可使用身份证复印件或户口薄复印件；提交办理宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；如果所申请房屋涉及到城乡规划还需出具申请登记房屋符合城乡规划的证明；需要提供房屋测绘报告或者村民住房平面图；

3、收集齐以上几个所需材料后，申请人向当地房屋管理所提交这些材料；

4、等待房屋管理所受理，并进行公告、审核，同时需交一定的费用，最后就是等待发证。

同城市房屋一样，农村建房也是有房产证的。因为根据我国《物权法》的规定，房屋这类财产只有办理了登记，领取了房产证，才能证明你是真正的房屋所有人。因此，农村建房也是有房产证的。