怀孕生育是个极其复杂的环节，任何一个小环节出错，都会导致不孕症。长时间不来月经容易引发其他疾病从而导致不孕。此外，闭经本身很可能是其他妇科疾病或全身疾病的表现，很多妇科疾病若不及时治疗也会导致不孕。

神经内分泌功能失调引起的闭经：下丘脑一垂体一卵巢轴中的一个或多个环节功能失调引起无排卵，这会导致闭经，是月经病的病理生理基础之一，也是不孕的原因之一 。有些患者虽然排卵但黄体功能不足，也能引起不孕。

卵巢、子宫等疾病引起闭经：卵巢、子宫出现问题往往会反应在月经改变上，如卵巢囊肿、子宫肌瘤、多囊卵巢等这些问题引起的闭经，必须先治疗原发病，原发病消除后，月经自然回到正常，不孕问题也会随之解决。