不同点：

菌类植物不含叶绿素、不能进行光合作用（极少数光合细菌除外）；腐生生活或寄生生活，即异养生活。无性生殖器官多为单细胞结构。菌类的生活环境比较广泛，在水、空气、土壤以至动、植物的身体内，它们均可生存。

藻类植物具有叶绿素、能进行光合作用、营光能自养型生活。有性生殖器官一般都为单细胞，有的可以是多细胞的，但缺少一层包围的营养细胞，所有细胞都直接参与生殖作用。一般生长在水体中。

相同点：低等植物，无根茎叶分化、无维管束、无胚。