小产权房的房产证由乡镇颁发，个人并没有实际的产权，个人想要转让小产权房，必须在购买满五年之后才能够进行。小产权房的建设用地一般是归乡集体所有，并且这类房产只能由这个乡的村民购买居住。购买小产权房之后，若要再转让，必须补交土地出让金，否则便不能够上市交易。大产权房的房产证由国家颁发，被国家认可和接受，职工可以自由或转让大产权房，没有时间上的限制。大产权房的用地是由国家划拨或者转让的，销售对象可以是任何人。购买大产权房之后，购买者可以自由进行使用、或转让，不用补缴任何费用。购买在建小产权房时，购房人与开发商签订合同并交付房款后，如果相关部门整顿乡产权房的建设项目，可导致部分项目停建甚至被强迫拆除。购房人会面临既无法取得房屋，又不能及时索回房款的尴尬境地。购房后如果遇到国家征地拆迁，由于乡产权房没有国家认可的合法产权，购房人并非合法的产权人，所以无法得到对产权进行的拆迁补偿，而作为实际使用人所得到的拆迁补偿与产权补偿相比微乎其微。