硝化细菌有细胞壁。硝化细菌是细菌，虽然硝化细菌都不是植物，但是硝化细菌都有细胞壁，因为在以细胞构成的生物中，除了动物，其他生物的细胞都有细胞壁。硝化细菌是革兰氏阴性菌，故其细胞壁由肽聚糖（基本结构），包括聚糖骨架，四肽侧链，外膜（殊成分），包括脂蛋白，脂质双层，脂多糖组成。