一、民政局协议离婚优点是比较方便，只要双方达成一致意见即可随时领取离婚证;而在起诉离婚程序较繁琐，需先立案后开庭再判决，时间相对较长。

二、民政局协议离婚经济成本低;而起诉离婚，无夫妻共同财产分割的，五十元，涉及财产分割的，需按照财产标的收费。

三、从协议的履行方面来看，民政局协议离婚所备案的离婚协议书虽然有效，但是不具有强制执行的效力。通过起诉离婚，有法院下达的调解书，具有可强制执行的效力。

【法律依据】

根据《婚姻法》第三十一条规定：男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。

根据《婚姻法》第三十二条规定：男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。