非法证据排除规则的适用程序：

(一)侦查阶段非法证据排除规则的适用

第一，以法律条文的形式确定了非法证据排除规则。

第二，赋予了辩护人在侦查阶段的权利和地位

第三，讯问过程中需要录音录像

(二)检察机关公诉阶段非法证据排除规则的适用

(三)庭审程序中非法证据排除规则的适用

【法律依据】

《刑事诉讼规则(试行)》第68条中规定了，检察机关在自行审查时如果发现存在非法证据的，要依法予以排除;除了依职权外，在侦查阶段还可以依申请排除非法证据，申请人即为当事人及其辩护人、诉讼代理人。