菌毛类型很多，根据菌毛功能可将其分为两大类：普通菌毛和性菌毛。

菌毛：在很多革兰氏阴性菌及少数革兰氏阳性菌的细胞表面存在着一些比鞭毛更细、更短而直硬的丝状物，称为菌毛或称伞毛、纤毛。菌毛在普通光学显微镜下看不到，必须用电子显微镜观察。菌毛由结构蛋白亚单位菌毛蛋白组成，具有抗原性。

菌毛直径大约3~7nm，长度约为0.5~6um，有些菌毛可长达20um。其化学组成是菌毛蛋白（Pilin），与鞭毛相似，也源于细胞质膜内侧基粒上。菌毛不具备运动功能，也见于非运动的细胞中。因机械因素而失去菌毛的细菌很快又能形成新的菌毛，因此认为菌毛可能经常脱落并不断更新。