根据情况而定。菠萝芯呈褐色一般是由于成熟过度或是腐坏而导致的，若是因为成熟过度而引起的颜色加深，则可以再继续食用，这种菠萝只是口感稍微欠佳，若是腐坏变质，则不能进行食用，以免造成身体不适。

菠萝保存方式：

1、冷藏保存：将切开的菠萝用密封盒或密封袋装好，置于冰箱冷藏室内保存即可。

2、冷冻保存：将菠萝切片或切块，用袋子装好，然后放在冷冻室内，可制成冻干菠萝片。

3、制菠萝酱：将菠萝洗净、泡盐水，然后切成小块，将其捣碎，用糖腌制放入密封玻璃罐中，在低温下存放即可。

4、制菠萝干：将菠萝切片后，放在烘干机中烘干，制成菠萝干，这样可以减少菠萝中的水分，进而降低被细菌污染的机率，延长保质期。