《钢之炼金术师》主要讲述的是主人公爱德华和他弟弟阿尔冯斯十分思念在他们还小的时候亡故的母亲，为了再次见到母亲，进行了炼金术中最大的禁忌人体炼成。可是因为炼成时的反噬，阿尔冯斯失去了全身，爱德华则失去了左脚，为了换回弟弟，爱德华牺牲自己的右手作为代价将弟弟的灵魂炼成，并将弟弟阿尔冯斯的灵魂固定在一副铠甲上。

从此爱德华和阿尔冯斯为了取回他们所失去的一切，踏上了找回自己身体的旅程。