肠道内有寄生虫，特别是蛔虫，它靠吸收人体内的营养而生存。宝宝的肚子里如果有寄生虫，其在里边经常活动，除了使人肚子痛，恶心，呕吐，严重者患肠梗阻外，宝宝在夜间经常磨牙的情况也是其引起的。

精神因素，白天过于疲劳或精神过于激动，特别是孩子玩得太累，入睡后大脑皮层没有得到完全的休息，部分神经仍处于兴奋状态，也会入睡后磨牙。

胃消化不良，胃的消化功能因某些原因如胃病等，导致食物在进入胃部之后不能被及时的消化掉，以致睡觉后磨牙。