处理器：红米手机3是高通骁龙616 CPU，红米3S改为高通骁龙430 CPU，两者均为A53八核内核，430的GPU为505，性能更高，另外430集成X6 LTE基带，而616集成X5 LTE基带。

存储：红米手机3为eMMC4.5，红米3S标准版为eMMC5.0，高配版为eMMC5.1，存储速度更高。

指纹识别：红米手机3S全面支持指纹识别。