非法同居问题的处理是：

1、未办理结婚登记而以夫妻名义同居生活的男女，一方要求“离婚”或解除同居关系的，经查证确属非法同居的，应一律判决予以解除。

2、离婚后，双方未再婚，在未履行复婚登记手续的情况下，又以夫妻名义共同生活，一方起诉离婚后，一般应解除其非法同居关系。

【法律依据】

根据《婚姻法司法解释二》规定，有配偶者与他人同居的，人民法院应当受理并依法予以解除。当事人因同居期间财产分割或者子女抚养纠纷提起诉讼的，人民法院应当受理。