蓝藻无叶绿体却能进行光合作用的原因是细胞质中有很多光合片层，叫类囊体，各种光合色素均附于其上，大大增加了细胞内的膜面积，形成了含有色素的膜性结构。蓝藻是最简单、最原始的自养植物类型，它能进行与高等植物类似的光合作用。藻体为单细胞或多细胞群体或丝状体。蓝藻细胞中的原生质体没有分化成细胞质和细胞核，而分化成周质和中央质，周质中没有线粒体、叶绿体等细胞器。蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、中心体、内质网和液泡等细胞器，唯一的细胞器是核糖体。含叶绿素a，无叶绿素b，含数种叶黄素和胡萝卜素，和藻胆素。