分居两年的证明证据一般包括：一方在外居住的房屋租赁合同；双方签订的夫妻分居书面协议，口头协议的必须对方承认；一方向另一方以快件邮寄发出的夫妻分居书面协议，备注栏标明“分居”，自邮寄凭证上的邮寄之日起到提出离婚之日属于夫妻分居期间；能够证明双方感情不和而分居事实的双方书信或电子邮件；证人证言，但不能作为孤证。

法律依据：我国《中华人民共和国民事诉讼法》规定如下：第六十三条证据包括：(一)当事人的陈述;(二)书证;(三)物证;(四)视听资料;(五)电子数据;(六)证人证言。