拘留的种类有三种，分别为行政拘留、刑事拘留、司法拘留。案底是指有犯罪记录。对于拘留三天是否会留案底，需要看拘留的种类来决定。如果是行政拘留并不会留有案底，因为行政拘留是违反了治安管理法所作出的处罚；如果是刑事拘留，就会留有案底；如果是司法拘留，虽然不会留有案底，但是会影响政审。

法律依据：根据《刑事诉讼法》规定，犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。