理论上不应该停缴，因为取保候审只是刑事案件侦查、审查起诉阶段的一种强制性措施，并不代表犯罪嫌疑人确实有罪。劳动合同法规定，在员工被依法追究刑事责任的情况下用人单位可以开除，所以，取保候审期间用人单位开除作为犯罪嫌疑人的员工是不合法的。

【法律依据】

依据《刑事诉讼法》第十二条：未经人民法院依法判决，对任何人都不得确定有罪。