淀粉遇碘变蓝是由于淀粉的分子和碘分子形成了络合物，这种络合物对不同波长的光反射和吸收作用不一样，导致看起来是蓝色的。并不是两个物质中有一个自己变了颜色，或者是甲使乙变色，而应该说是两个一起变色，或者说，这种变化是两种物质共同作用的结果。

溶于水中的直链淀粉，呈弯曲形式，并借分子内氢键卷曲成螺旋状。这时加入碘酒，其中碘分子便钻入螺旋当中空隙，并借助范得华力与直链淀粉联系在一起，从而形成络合物。