门源属于中国青海省东北部，属海北藏族自治州管辖，在海北藏族自治州东部，东部和北部与甘肃省相邻。距省会西宁150公里，距海北州州府驻地海晏县250公里。

门源回族自治县位于中国青海省东北部，总面积6896平方千米，属海北藏族自治州管辖，在海北藏族自治州东部，东北与河西走廊中部的甘肃省天祝、肃南、山丹县接壤，南接青海省大通、互助县，西与本州祁连、海晏县毗邻。