公寓在过户的时候需要缴纳的税费要高于普通住宅，因为房屋产权在变更的时候需要缴纳相关的费用，其中契税是占比比较大的部分，因为公寓是属于商业用房，与普通住宅相比，需要缴纳的契税税率会更高一些，就会导致税费更高一些；契税缴纳之后，法定继承人继承房产的话，免征税费，非法定继承人依照遗嘱接受土地房屋权属的，需要缴纳契税的1.5%；公寓在过户的时候，还需要缴纳营业税和个税以及交易手续费等，综合下来，公寓的过户税费就会出现比普通住宅高的现象。