关于双重劳动关系的争议的处理是：

1、停止办理职工停薪留职手续;

2、不得再为职工办理挂名手续;

3、解决好两不职工的劳动关系;

4、加强对学习、培训人员的管理;

5、彻底清理外出劳务人员;

6、取消外借，建立合理流动制度。

【法律依据】

根据《劳动合同法》第三条，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。