菌落形态包括菌落的大小，形状，边缘，光泽，质地，颜色与透明程度等，细胞形态是菌落形态的基础，菌落形态是细胞形态在群体集聚时的反映。

菌落形态描述如下：

细菌是原核微生物，故形成的菌落也小；球菌形成隆起的菌落；有鞭毛细菌常形成边缘不规则的菌落；具有荚膜的菌落表面较透明，边缘光滑整齐；有芽孢 的菌落表面干燥皱褶；有些能产生色素的细菌菌落还显出鲜艳的颜色。