完善科技创新的体制机制原因如下：

总体上经济发展的技术含量仍然不高，重要产业对外技术依存度仍然较高，很多关键核心技术受制于人，战略高技术领域科技力量薄弱；近年来科技投入大幅增长，组织实施了大批科技发展项目，但科技创新的质量和效率有待提高，目前我国科技人力资源总量位居世界第一，国际科学论文数量世界第二，全社会研究开发经费总额世界第四，发明专利授权量世界第四，但我国的科技成果整体水平不高，投入产出效率问题比较明显；科技与经济脱节问题依然严重，科技面向经济、经济发展依靠科技的局面尚未全面形成，众多的科研成果只有很少部分转化为现实生产力；企业创新的积极性仍然不高，企业创新动力和综合竞争力明显不足，国家出台的各项鼓励企业自主创新的财税、金融、产业、政府采购等政策尚未真正落实到位，产学研结合的创新体制还未普遍形成，企业要成为技术创新的主体还有较大差距。