吲哚乙酸是蛋白质，吲哚乙酸是由色氨酸合成的，化学结构中没有肽键，从这点就可判断它不是蛋白质。吲哚乙酸是一种化学物质，是小分子，而蛋白质是大分子，是生命物质。虽然与蛋白质相同都是由CHON四种元素组成，蛋白质还会有S，以及一些其他元素的加入，如血红蛋白有Fe。