1、特点。马克笔笔头分为扁头和圆头双头，使用时以扁头为主，圆头为辅助修饰，马克笔的色彩丰富，在饱和度上相比较水彩笔较低，而透明度则较强，水分均匀易于多层上色；水彩笔的笔头主要为圆头，颜色饱和度高，色彩相比较马克笔较少，透明度较低，水分分布不均匀，不适合反复叠色和细节的刻画。

2、颜色。马克笔的应用面较为广，色彩种类较多，并且所使用的不同领域分为多个系列进行使用，如环境设计多使用绿色、蓝色和原木色等，而服装设计则大多使用浅色和饱和度较低的颜色来进行使用。水彩笔大多饱和度高，色彩鲜艳对比强烈，一般分为12、24、36、48色，主要因使用领域大多为儿童和标记使用，只需色彩对比强烈的颜色，48色则足以。

3、用纸。马克笔用纸要求纸张的厚度以及光滑度，需要选择专门的马克笔用纸或者铜版纸，其他纸张虽然也可以使用，但是易于渗透。水彩笔和马克笔虽也易渗透，但是水分不均匀，一般只要使用较硬的水粉纸、白板纸、水彩纸即可。

4、应用面。马克笔属于专业性的绘画工具，应用面十分广泛，如各类艺术专业的绘画、广告标语、设计物品、海报以及插画等。水彩笔饱和度较高对比强烈，而多应用于儿童绘画和标记。