大豆根在生长过程中向土壤中分泌一些物质，刺激根瘤菌向 根附近运动，并进行繁殖，根瘤菌能把根分泌的色氨酸转化为激素类物质，大豆根毛在这种物质的刺激下分生卷曲，同时，根瘤菌侵人根毛，并在其中形成浸染丝，根瘤菌通过浸染丝进入根的 内皮层细胞。在根瘤菌分泌物的刺激下，内皮层细胞大量繁殖，产生大量细胞，把根瘤菌包围起来，并把根瘤菌推到根外，形成 根瘤。根瘤近圆形或卵圆形。最初生成的根瘤为绿色，之后变为 粉红色，后期变为褐色。一般根瘤的直径在4〜5mm,大多单个生长。