东城办事处、西城办事处、南城办事处、北城办事处、牡丹办事处、何楼办事处、沙土镇、吴店镇、王浩屯镇、黄堽镇、都司镇、高庄镇、小留镇、李村镇、马岭岗镇、安兴镇、大黄集镇、胡集镇、皇镇乡。

菏泽市牡丹区，地处鲁、苏、豫、皖四省交界处，是菏泽市辖行政区，鲁西南政治、经济、文化中心。总面积1140平方公里，人口105万，是全国著名的“戏曲之乡”、“书画之乡”、“武术之乡”、“民俗之乡” 和“中国牡丹城”。