江西农业大学教务处是江西农业大学全日制普通本科教学工作的行政主管部门，主要的职能是组织学校全日制本科日常教学管理和教学运行工作，贯彻执行上级教育行政部门的教育教学管理政策，制定学校本科教育教学的总体发展规划，提出学校本科教学改革的方案和措施，拟订并组织执行学校教学工作规章制度、人才培养方案和教学工作计划，开展教育教学研究以及完成上级领导交给的其他任务。江西农业大学教务处下设办公室、教学运行科、学籍科、教学研究与建设科、教学质量与评估科、实践教学科、教室管理站等七个科室。