秦在公元前221年灭亡六国的根本原因是：

1、秦国统一中国是符合历史发展的趋势和客观要求的。战国时期的社会经济发展要求消除封建割据，实现全国大一统，人民普遍厌战，要求结束战争给人们生活带来的极大破坏；

2、秦国具备了统一中国的客观条件。秦与关东六国不同，它的变法比较彻底，政治上已基本建立起了专制主义的中央集权的政治制度。废除了领主制的农奴制度，建立了土地私有制，奖励耕织，促进生产，奖励军功提高战斗力。秦的疆域不断扩大。到秦昭王时已超过关东六国的疆土的总和，社会稳定，政权巩固，经济发达。

所以，由秦统一中国消灭六国是历史的必然趋势。