微生物包括：

细菌：革兰氏阴性的如铜绿假单胞菌，大肠杆菌，沙门氏菌等，革兰氏阳性如金黄色葡萄球菌，链球菌、梭状芽孢杆菌等。

放线菌：如链霉菌属。

真菌：真菌分为霉菌、酵母菌、蕈菌，霉菌有黑曲霉、毛霉、青霉、根霉等，酵母菌有酿酒酵母，白色念珠菌，假丝酵母。

蕈菌是大型子实体真菌，蘑菇。