东台吉尔湖区是在格尔木市。东台吉乃尔湖在柴达木盆地内，湖盆外围为第四系洪积，冲积，风积和湖相粘土及化学类型沉积，滨湖大多为湖积和湖相化学沉积，盐碱地广布，东部为近50平方公里的沙质干盐滩。

湖区属柴达木荒漠干旱，极干旱气候，年均气温两度，年降水量不足25mm。集水面积38500平方公里，补给系数156。湖水主要依赖东台吉乃尔河补给，东台吉乃尔河，其上源为那棱格勒河和洪水河，源于昆仑山鹤托坂日雪山和布喀达坂雪山。