概念不同、标准不同。

1、概念不同：水深是指水面到底的高度。水位是指水面到基准水位的高度。基准水位是由国家制定的，海边是用某一海面做基准。内陆是用国家定下的吴淞基面为基准。

2、标准不同：水位是反映水体水情最直观的因素，它的变化主要由于水体水量的增减变化引起的。水位过程线是某处水位随时间变化的曲线，横座标为时间，纵座标为水位。而水深指水体的自由断面到其河床面的垂直距离。