“活化分子”的定义现在不是很明确。如果把它当作能量高于活化能的分子的话，那么随着活化能的降低，活化分子呈指数增加。因为分子的能量满足玻尔兹曼分布，这是一个指数分布。

活化能是指化学反应中，由反应物分子到达活化分子所需的最小能量。以酶和底物为例，二者自由状态下的势能与二者相结合形成的活化分子的势能之差就是反应所需的活化能，因此不是说活化能存在于细胞中，而是细胞中的某些能量为反应提供了所需的活化能。