氨氮主要源于有机氮污染，是水体富营养化的重要指标，而氨氮超标在微生物作用下，可分解成亚硝酸盐氮，最终成为硝酸盐氮，是微生物对水体的精华过程，但是一方面微生物的大量繁殖，例如藻类过量繁殖，引起水华赤潮，其代谢产物，例如藻毒素有致肝癌等毒性。另一方面当水中的亚硝酸盐氮过高，饮用此水将和蛋白质结合形成亚硝胺，是一种强致癌物质。长期饮用对身体极为不利。