1、蒜种的问题。蒜种的蒜瓣挪动容易受伤而造成烂根；

2、保管不善。收种时蒜头淋雨发霉，有铁锈色的根容易烂根；

3、水分管理不当。在24小时淹水的情况下，根系会产生无氧呼吸，导致根系受害，严重的会死亡。根系初为黄色，后变黑，病菌侵染导致烂根；

4、肥料管理不当。土壤有机质含量不高，土壤板结，导致植株抗逆性下降；

5、病害导致。常见的有根腐病、软腐病，这两种病害都是导致烂根的主要病菌，尤其在重茬地块更严重。