2000年，上海医科大学与复旦大学合并，现称复旦大学上海医学院。

现如今，全国医科大学排名前五为：

清华大学北京协和医学院北京大学医学部复旦大学上海医学院上海交通大学医学院华中科技大学同济医学院从排名可以看出上海医科大学在全国排名第三。