胎儿肠管畸形怀孕中晚期会出现。女性在怀孕三个月左右，胎儿就会成型，随着孕周的增加，胎儿的实质器官就会慢慢长出。如果在怀孕中晚期有胎儿消化道的畸形，孕妇就可能出现羊水量的异常增多，或者羊水量减少。如果是羊水量异常增多，就会导致腹部隆起，比相应的孕周明显的表现。如果是羊水量减少，腹部隆起就会比相应孕周缩小。但由于只是胎儿消化道畸形，所以母体是没有特别的不良表现的。