南京博物院是中国第二大博物馆，全国重点博物馆。由历史馆、艺术馆、特展馆、数字馆、民国馆和非遗馆组成，以下对于各馆特色作出简略介绍。

1、历史馆常设“江苏古代文明”展览，通过大量的文物和标本直接说话，彰显展示效果；

2、特展馆内设有10个展厅，用于举办临时展览与特别展，体现不同文化艺术之间的交流融合；

3、艺术馆内设有8个展厅，按照艺术品的分类设古代绘画、古代书法等专题陈列，同时设立名人艺术专馆，包括国画大家傅抱石、油画大师苏天赐等；

4、数字馆分为实体馆、网络虚拟馆两个部分，其中实体馆基于人类情感，展现了中国古代文明。网络虚拟馆不仅在线复原了实体展馆，而且则以网络为平台，集合观众智慧打造永不闭馆的“网上博物馆”；

5、民国馆以所在地南京的地域文明为主题，直观展示民国时期的市民生活；

6、非遗馆即江苏非物质文化遗产展示馆，展示了热闹的民俗活动，传统的手工艺，和传统口头表演等。