六角恐龙鱼分公母是公性六角下体比母六角稍突出，母六角下体略微扁平，一般只要有两种同时存在的话，对比一下就比较容易区分出来了。

六角恐龙鱼身体长度只有七厘米，宽度大概也只有5厘米。头额宽而扁平，小而圆的眼睛滴溜滴溜的，非常机灵。脑后凸出的羽状腮呈齿状横置，腮上共有六个“齿”，这些“齿”状腮从体侧到头顶像“角”一样向上高高竖起，“角”上还带有漂亮的“鬃毛”状羽。