办理三副签证步骤如下：

1、确认满足办理签证的条件；

2、准备办理需要的文书；

3、明确受理部门为海事船舶签证点，接办岗位为船舶签证监督员，申办单位为船舶及其所有人、经营人、代理人；

4、依据《中华人民共和国船舶签证管理规则》当场办理签证；

5、对符合规定的，准予签证。