截止到2018年3月，中科院共计有3个数学研究所：

1、中国科学院数学研究所成立于1952年，著名数学家华罗庚为首任所长。数学研究所致力于“创造自主的数学研究”，为此获得国家自然科学一等奖3项，国家自然科学二等奖8项，在纯粹数学与应用数学，在计算机研制、“两弹一星”等尖端项目中均作出了重要贡献。

2、中国科学院武汉物理与数学研究所，成立于1957年，现在拥有4个博士点、多个硕士点和1个博士后流动站，同美、英、日、法等20余个国家和地区的著名学府和科研机构建立了合作交流关系。